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2019冠病疫情爆发以来,科学家一直监测该病毒的基因序列,以便了解病毒突变的情况。

现在,世界卫生组织已鉴定4种2019冠病“关切变种”(Variant of Concern,VOC)病毒,以作更密切的检查。

令人担心的是,一些变种病毒会削弱疫苗的效能,而这些变种病毒已在马来西亚流传。

本文探讨变种病毒出现的原因,及其对马来西亚2019冠病免疫计划的影响。

为何会有变种病毒?

2019冠病病毒于人群传播时,会复制本身的基因密码(genetic code),自然会发生一些“错误”。这些突变大部分是良性的,甚至对病毒本身有害。但有时极少数的突变可能使病毒对人体产生更剧烈的影响。

这导致新的变种病毒传染力更强,可在人群中传播得更快、更远。这类变种病毒所感染的人越多,就越有可能再度出现新的突变。

科学家不断从2019冠病确诊患者身上采样,以作全基因组测序(full genome sequencing)。这是非常专业的工作,可测得确诊者身上的2019冠病病毒之基因密码。

这是为了寻找那些会使疫情恶化的病毒突变。因为,现有的检测程序可能无法检测到这些变种病毒,或这些突变会加强病毒的传染力或致死率,甚至削弱疫苗效力。

图一:电脑显示的2019病毒放大图,其刺突蛋白标上红色,若有变异就会影响病毒的作用。 

不同卫生机构的定义可能稍有不同;但普遍而言,2019冠病变种病毒可分为两种。

其中一种是“存疑变种(variant of interest,VOI)”,意即其严重性尚待观察的变种病毒。

若可证明一“存疑变种”具有较强的杀伤力,那它就会被归类为“关切变种(Variant of Concern,VOC)”,即需要更密切监督的变种病毒,可能也需以更严格的措施来防止它扩散。

什么是关切变种(VOC)?

目前,世界卫生组织已经鉴定4种关切变种。

其中有去年9月率先在英国鉴定的B.1.1.7变种。它的传播力更强,但现有疫苗能够有效对抗此一变种病毒。

根据世界卫生组织,截至今年5月11日为止,全球共有149个国家出现这种B.1.1.7变种病毒。

去年5月,南非也发现一种新的变种,其编号为B.1.351。此变种病毒不仅传播力更强,还会削弱疫苗效力,且可导致2019冠病康复者再度感染。迄今,已有102个国家出现这个变种病毒。

另外,日本也在去年11月,于当地的巴西旅客身上监测到2019冠病新变种,即B.1.1.28.1(或称为P.1)。它的特性与南非变种病毒相似,目前已有60个国家通报发现此变种。

图二:这是根据基因序列排列的全球2019冠病变种,其中含有四种关切变种。这些变种都是中国武汉的2019冠病病毒演化而来。

印度变种病毒(B.1.617)则是于去年10月在印度发现,它最初是“存疑变体(VOI)”,直到本周一当地爆发致命疫情时,此变种病毒才被视为关切变体(VOC)。

印度变种病毒实际上有三个子变种,即B.1.617.1; B.1.617.2;及B.1.617.3。此变种的确切资料不多,但其传播速度似乎比英国变种病毒还要快。一些研究报告表明,它比更早之前的变种病毒,更能引发严重疾病。

据了解,印度变种病毒或可以规避疫苗所诱导出的抗体,但不足以使疫苗失效。截至5月11日,已有44个国家通报录得印度变种病毒案例。

去年热议的D614G变种病毒是什么?

自中国武汉首次发现2019冠病病毒以来,该病毒已经历经多种变异,而D614G变种病毒只是一种。

其实,上述四种关切变种(VOC)都带有6到12种变异特征,使得它们与其他变种有所区别。

有些变异会出现在好几种变种病毒中。比如说,E484K变异就存在于南非变种病毒(B.1.351)及巴西变种病毒(P.1)中,使得这两种变种病毒得以规避疫苗诱发的抗体,进而削弱疫苗的效力。

而印度变种病毒的其中两个子变异,即B.1.617.1及B.1.617.3都带有相似的E484Q变异。

至于D614G变异,则有强大的传染力。它也是世卫组织鉴定的4种关切变种中同时存在的变异“关键特征”。

马来西亚迄今发现哪种变种病毒?

马来西亚本地变种病毒为B.1.524,但既不属于“存疑变种”(VOI),也不是“关切变种”(VOC)。仍在国内传播的B.1.470及B.1.466.2变种病毒亦是如此。

然而,4种“关切变种”病毒中,就有3种,即英国、南非及印度变种病毒,最近已确认在大马境内传播;仅巴西变种病毒(P.1)尚未在国内传播。其中,南非变种病毒是大马传播最广的变种。

卫生总监诺希山昨日指出,南非变种病毒再添4宗确诊病例,使该变种病例目前累计至66宗。这些南非变种病例均发现于雪兰莪、吉隆坡、霹雳、吉打、和森美兰地区。

这些病例大多隶属于各个簇群,仅19名患者是与任何簇群无关的近距离接触者。另有1宗病例则是在出现2019冠病症状后,现身检测(有症状筛查)并确诊。

此外,亦有一名感染南非变种病毒的患者是接种疫苗后感染,另一名患者则是2019冠病康复后再度感染。

英国变种病毒迄今在本地总共检测到3宗病例,即雪州的“美佳再也巷簇群”1宗,及沙巴近距离接触者筛查2宗。另有5宗属境外输入病例。

印度变种病毒目前有5宗。所有患者皆有印度旅行史,其中3人是在飞抵马来西亚隔离后确诊。

另有1名患者4月7日从印度抵马后,同一天及4月12日的两次检测结果都呈阴性;但却在4月21日出现严重症状入院,随后于5月1日因2019冠病身亡。

剩下的1宗印度变种病例,则是有症状筛查后测得。

不过,应该谨慎看待上述资讯,因为仅有少数的病例做了基因序列检测,而且上述的变种案例也是确认基因序列后的案例。尚有许多病例未做基因序列检测,或做了检测但还未确认其基因序列。详情见下面说明。

疫苗抵抗变种病毒的能力如何?

卡塔尔的一项研究显示,辉瑞(Pfizer-BioNTech)在预防南非变种病毒感染的效能达75%,而对预防重症及死亡的效能则高达100%。

相较之下,早前的试验表明,辉瑞疫苗预防2019冠病症状的功效为95%。

阿斯利康(AstraZeneca)疫苗在南非的试验则显示,该疫苗对抗轻度至中度的南非变种病毒,效能仅有10.4%。

不过,这项研究有一些问题。首先,此研究的规模很小,意味着研究结果的误差会很大。

其次,无论被试者接种疫苗与否,研究中并没有人因为患上2019冠病而引发重症或死亡。这表示此研究无法就阿斯利康疫苗能否预防重症或死亡,做出结论。这同样归因于研究规模过小。

尽管如此,此研究加上早前令人失望的10.4%研究结果,已使南非政府放弃使用阿斯利康疫苗。

据报道,阿斯利康正研发一种可对抗所有变种病毒的新版疫苗,盼可在今年下半年投入使用。

同时,《路透社》引述消息称,阿斯利康疫苗在对抵抗巴西变种病毒(P.1)方面仍然有效。

另一方面,巴西临床试验表明,中国科兴疫苗(Sinovac)对2019冠病症状的预防效能为50.38%,而按照“真实世界研究”,科兴疫苗的效能约为49.6%。

临床研究方法可分为:比较效果研究(Comparative Effectiveness Research)、实效研究(Outcome research)、真实世界研究(real-world study)。所谓“真实世界研究”指的是研究对象和药物治疗等方面没有严格限定,较为贴近于临床实际。

在变种病毒仍未普遍的印尼,中国科兴疫苗的效能则达到94%。

俄罗斯卫星五号(Sputnik V)疫苗制造商声称,该疫苗对南非变种病毒的功效有所降低,但整体效能仍优于其他疫苗。但他们尚未发布数据支持这项声明。

康希诺生物疫苗 (CanSino Biologics)对冠病变种病毒的效能则还未公布。

所有疫苗对抗英国变种病毒的效能,都与对抗旧有冠病病毒一样有效。

然而,英国变种病毒传播力更强,这表示需要更多人接种疫苗,才能达到群体免疫。此理论也适用于其他高度传播的变种病毒。

至于印度变种病毒,虽然至今未能定论,但有消息显示,疫苗对此变种病毒仍然有效。

实验室研究发现,各疫苗在对抗印度变种病毒时,效能会降低,但降幅仍不比对抗南非变种病毒时来得大。

但是,这类实验仍不足以说明疫苗在现实世界中的效能。其中一个原因是,抗体仅是复杂免疫系统的其中一部分。

同时,英国昨天录得更多人感染印度变种病毒,当地卫生大臣马修汉考克(Matt Hancock)告诉国会下议院,绝大多这类患者都是符合接种疫苗资格但仍未接种的人。

他续说,这表示变种病毒不会扩散到已接种的老年人群体。

英国目前使用的疫苗有辉瑞(截至5月5日用了1140万剂)、阿斯利康(2330万剂)和莫德纳(Moderna,约10万剂)。

我们能知道变种病毒在哪里冒现吗?

简而言之,不能。如前所述,全基因组测序(full genome sequencing)是高度专业的工作。只有少数国家有能力定期执行,并在国内大量采样和测序。

全球超过1亿6000万例冠病确诊病例中,只有大约150万例被测序,并在Gisaid平台上分享。

过去,研究人员使用Gisaid平台,迅速分享流感病毒的基因资讯,此平台后来也被用来监督2019冠病病毒的基因序列。

近半数的2019冠病样本是来自英国及美国,大部分国家提交的样本非常少。

比如,截至5月17日为止,大马仅分享了683个基因序列测序,仅占全国确诊病例的0.14%。

邻国新加坡则提交了3.91%的确诊病例的基因序列测序结果;而印尼分享的测试结果,数量仅占其全国确诊病例的0.1%。

反观,一些发达国家,如冰岛,就分享了高达77.6%的确诊病例之病毒基因序列,澳洲则测了59.1%的确诊病例;不过,这两个国家的累计确诊病例都不高,分别是6549宗及2万9992宗。

另一方面,全球约50个国家及地区完全没有在Gisaid平台上提交任何基因序列测试结果,比如洪都拉斯等累计病例达到数十万宗的国家。

这使得全球冠病病毒变异的情况,留下了巨大的盲点。

更何况,使用基因序列鉴定2019冠病病毒变异,只是最初的阶段,接下来还需确定这些突变是否会对病毒的作用带来关键影响。

马来西亚的全国冠病免疫计划已拨出一部分款项,加强监测2019冠病基因组,以确保马来西亚采购的疫苗足以对抗国内的流传的变种病毒。


原文是由《当今大马》英文版助理编辑高俊麟撰写,中文版记者叶蓬玲及实习记者陈敬谦翻译。